Phylogenie - TARA23S_3634010
Result of transcription and translation of DNA sequence (Emilie Chantoin_ Lina Andersson)
Laura Gauché
Emilie Chantoin
Ruri Shu
Anais Feldmann
Ruben Manuel
Tomas Rigaux
Lina Andersson
Phylogenie - TARA7S_3634040
40 - BLAST
résultat de la phylogénie 3634040
Ecole internationale PACA Manosque
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Feutris de cyanobactéries filamenteuses (C. Sardet/CNRS/Tara océans) |
Ecole internationale PACA, Manosquehttp://www.ecole-internationale.ac-aix-marseille.fr/spip/spip.php?rubrique131 Professeur participant au projetStéphane Amilhat stephane.amilhat-at-ac-aix-marseille.fr Classe concernée : option Lab Sciences (1S / S6)nombre d’élèves: 8 élèves PartenairesTara océans Laboratoire d'Information Génomique et Structurale, CNRS UMR7256 Aix-Marseille Université
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Problématique du projet: Pour ce projet nous travaillons en collaboration avec Pascal Hingamp, un biologiste du laboratoire de génomique de l'université Aix-Marseille, afin de déterminer et classer les différents échantillons récoltés lors de la mission Tara océans. Notre étude se fonde sur l'étude des échantillons d'ADN récoltés et séquencés par le génoscope. .
Objectifs du projet: L'étude des séquences d'ADN récoltées nous permet, via le site www.annotathon.org, de rechercher les séquences homologues aux séquences récoltées et d'établir une phylogénie de ces séquences. Des logiciels de bioinformatique nous permettent de transcrire et traduire les séquences d'ADN récoltées, de rechercher les protéines homologues (BLAST) et de les situer dans leur contexte phylogénétique.
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