outils de récolte du plancton
analyse FLOWCAM
mesure des conditions physiques et chimiques du lieu de prélévement
filtration des espèces planctoniques
découpage de l'ADN
préparation de l'ADN
préparation de la cuve d'électrophorèse
préparation de l'ADN
séquenceur 1ère génération
séquenceur 2ème génération
analyse des résultats de séquençage
Le GENOSCOPE nous a mis à disposition des séquences issues des échantillons TARA sur leur site. Nous avons utilisé trois banques de données informatiques : ANNOTHATON (recherche de séquences ORF contenant des séquences codantes) ; INTERPROSCAN (recherche de fonction biologique proche de celle de la séquence codante trouvée) et NCBI (recherche des espèces contenant cette protéine)
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analyse génétique
- utilisation successive des trois outils informatiques
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nos résultats
- Nous avons analysé une centaine de séquences et comptabilisé les espèces qui revenaient régulièrement dans les résultats. Par analyse statistique, nous pensons que deux espèces ont de fortes chances d'être présentes dans cet échantillon
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